Guayaquil City

Comenzó como un convenio realizado por el Club Atlético River Plate por primera vez fuera de Argentina, que llegó a Ecuador por recomendación de Alberto Montaño a César Vigevani. Fue entonces que viajaron a Ecuador y le presentaron la propuesta al Dr. Mario Canessa Oneto.

Se inició en julio de 2007 con un concurso llamado La Banda Roja te espera, el cual consistió en evaluar a chicos de todas las edades con el fin de armar divisiones inferiores del nuevo club y también buscar talentos con la posibilidad de que viajen a Argentina a probarse en las divisiones inferiores del Club Atlético River Plate. Como resultado, cuatro chicos ecuatorianos fueron seleccionados y viajaron a Argentina a entrenar con el primer plantel del Club Atlético River Plate.​

El club debuta en el torneo de Segunda Categoría de Ecuador en el año 2008, consiguiendo el título del Campeonato Provincial Segunda Categoría del Guayas en el mismo año. En 2009, el convenio entre el club guayaquileño y el Club Atlético River Plate se rompió, la ruptura se dio por la falta de apoyo del cuadro ‘millonario’,​ a pesar de ello el club lograría ser bicampeón del torneo provincial y subcampeón del Campeonato Ecuatoriano Segunda Categoría 2009 con lo cual consiguió el ascenso a la Serie B.

Cinco años después, River ascendió a la serie de privilegio tras quedar subcampeón del Campeonato Ecuatoriano Serie B 2014 al vencer con un marcador de 2 a 1 al Delfín en el Estadio Jocay de Manta.​

El 31 de enero de 2015, River Ecuador disputa su primer partido oficial en la Serie A de Ecuador ante el también recién ascendido Aucas. Este partido fue disputado en el Estadio Christian Benítez Betancourt en el cual River consiguió una victoria de 2 a 1 con anotaciones de los jugadores Deny Giler y Daniel Néculman.​

El 11 de julio de 2017, en la última sesión de la Federación Ecuatoriana de Fútbol, el Comité Ejecutivo procedió a notificar el cambio de nombre la institución. El Ministerio del Deporte aprobó que el conjunto guayaquileño se llame oficialmente como Guayaquil City Fútbol Club.​

El equipo no consiguió buenos resultados en la temporada 2018 por lo que ocupó el último lugar de la tabla acumulada con 30 puntos en la misma temporada con lo cual el equipo descendió a la Serie B al quedar último con 30 Puntos en la lucha con los equipos El Nacional 39 Puntos, Técnico Universitario 42 Puntos y Deportivo Cuenca 45 Puntos, sin embargo una modificación en el reglamento para el año 2019 de la Asamblea General de Clubes aprobó que se juegue la Liga Pro con 16 equipos, sumándole a los 12 actuales dos de los cuatro socios que en ese entonces se encontraron participando en el Campeonato de la Serie B.

El 2 de diciembre del 2023 al perder el partido 0-2 contra Gualaceo la escuadra guayaquileña en el duelo de colistas descendió a la Serie B por primera vez.