La selección de fútbol sub-20 de Uganda es el equipo nacional de fútbol masculino sub-20 de Uganda y está controlado por la Federación de Fútbol de Uganda. Representa a Uganda en competiciones internacionales de fútbol sub-20, como la Copa Africana de Naciones Sub-20.

Uganda ha participado en seis torneos de la Copa Africana de Naciones Sub-20, con su mejor resultado siendo el cuarto lugar en 2009. También han participado en dos torneos de la Copa Mundial de Fútbol Sub-20, en 2005 y 2017.

Algunos de los jugadores más notables que han jugado para la selección sub-20 de Uganda incluyen a Farouk Miya, Moses Oloya, Geoffrey Massa y Derrick Walulya.

El equipo está actualmente dirigido por el entrenador Morley Byekwaso.