El Huachipato sub-20 es el equipo de fútbol juvenil del Club Deportivo Huachipato. Fue fundado en 1978 y actualmente participa en el Campeonato Nacional Juvenil de Chile, la máxima categoría del fútbol juvenil en Chile.

El Huachipato sub-20 ha ganado el Campeonato Nacional Juvenil en cuatro ocasiones, en 1986, 1994, 2007 y 2008. Además, ha sido subcampeón en dos ocasiones, en 1985 y 1993.

El equipo ha participado en varias competencias internacionales, incluyendo el Campeonato Sudamericano de Fútbol Juvenil, la Copa Libertadores de América Sub-20 y la Copa Mundial de Fútbol Juvenil de la FIFA.

El Huachipato sub-20 es considerado uno de los mejores equipos juveniles de Chile y ha producido varios jugadores que han pasado a tener carreras exitosas en el fútbol profesional.