El Santa Clara B es el equipo filial del Clube Desportivo Santa Clara, que juega en la Segunda División de Portugal. El equipo fue fundado en 1999 y juega sus partidos como local en el Estádio de São Miguel, en Ponta Delgada, Azores. El Santa Clara B ha ganado la Segunda División de Portugal en una ocasión, en la temporada 2017-18.