Borneo FC sub-20 es un equipo de fútbol de Indonesia con sede en Samarinda, Kalimantan Oriental. Es el equipo sub-20 del Borneo FC, que juega en la Liga 1 de Indonesia, la máxima categoría del fútbol indonesio.

El Borneo FC sub-20 fue fundado en 2017 y juega sus partidos como local en el Estadio Segiri. El equipo ha ganado la Liga 1 sub-20 en dos ocasiones, en 2019 y 2021.

El actual entrenador del Borneo FC sub-20 es Fachri Husaini, quien es un exfutbolista internacional indonesio. El equipo está compuesto principalmente por jugadores jóvenes y prometedores que aspiran a representar a Indonesia a nivel internacional.

Borneo FC sub-20 es conocido por su estilo de juego ofensivo y su sólida defensa. El equipo tiene varios jugadores talentosos, incluidos el delantero Haris Hardiansyah y el centrocampista Alfriyanto Nico Saputro.

El Borneo FC sub-20 es un semillero de talento para el Borneo FC y la selección nacional de Indonesia. El equipo ha producido varios jugadores que han llegado a representar a Indonesia a nivel internacional, incluido Egy Maulana Vikri.